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中国科大团队推出RNA基础模型structRFM并全面开源
中国科学技术大学研究团队推出RNA序列基础模型structRFM,相关成果发表于《自然》。团队同时开放模型配对数据、权重及源代码,供科研人员使用。structRFM基于约2100万条序列—二级结构配对数据训练,预训练过程中联合学习序列上下文与结构依赖信息,可从RNA序列提取序列级、核苷酸级和核苷酸对级特征。基准测试显示,该模型可用于零样本同源性分类、RNA二级结构预测,并能改善三维结构预测;在剪接位点预测、IRES识别和非编码RNA分类等任务中也进行了验证。团队还报告了其对新RNA家族及长非编码RNA任务的应用表现。
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